I. Sposób nauczania
1. We wszystkich oddziałach obowiązuje ten sam Program Nauczania.
2. Program Nauczania obejmuje podstawowy materiał, który musi być zrealizowany przynajmniej w połowie (50%) przez każdą klasę (nauczyciel musi przerobić przynajmniej 3 z 6 podanych tematów).
3. Oprócz realizowania założeń Programu Nauczania, nauczyciel może przekazywać według własnych upodobań. Musi jednak pamiętać, że przed dopuszczeniem klasy do egzaminu końcowego, muszą być zrealizowane tematy z Programu Nauczania.
4. Zajęcia teoretyczne odbywają się w budynku Akademii Ninja.
5. Zajęcia praktyczne odbywają się na boisku Akademii Ninja i jako jedyne są obowiązkowe i stanowią 1/3 materiału obowiązkowego.

II. Program Nauczania

a. zajęcia teoretyczne
1. Państwo a wioska (podstawowe różnice; ważność obu jednostek)
2. Nindo (własna droga ninja)
3. Stopnie ninja (zakres obowiązków; warunki dopuszczenia; możliwości)
4. Podstawowy ekwipunek (sposoby zastosowania)
5. Jutsu - chakra (rodzaje technik i ich rangi)

b. zajęcia praktyczne
1. Podstawowe jutsu (nauka dwóch wybranych technik)

Każdy nauczyciel Akademii musi podpisać się pod Programem Nauczania, jako dowód na to, że się z nim zapoznał.